Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms