Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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