Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms