Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms