Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm1Q60636 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms