Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3aQ60520 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3aQ60520 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms