Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a3Q5XF89 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms