Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms