Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms