Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms