Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms