Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc27a5Q4LDG0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc27a5Q4LDG0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms