Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms