Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pydc3Q3V3Q4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms