Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ttc9Q3V038 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ttc9Q3V038 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ttc9Q3V038 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ttc9Q3V038 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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