Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms