Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3UPC7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3UPC7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3UPC7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3UPC7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3UPC7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3UPC7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3UPC7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3UPC7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3UPC7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms