Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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