Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Skap2Q3UND0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms