Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms