Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E330014E10RikQ3UL33 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E330014E10RikQ3UL33 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms