Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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