Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms