Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Puf60Q3UEB3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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