Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pid1Q3UBG2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms