Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LbrQ3U9G9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms