Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms