Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms