Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hace1Q3U0D9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms