Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms