Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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