Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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