Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrioQ0KL02 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TrioQ0KL02 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms