Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc7a1Q09143 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms