Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
MitfQ08874 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms