Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc4Q08624 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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