Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MestQ07646 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MestQ07646 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MestQ07646 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
MestQ07646 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MestQ07646 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MestQ07646 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms