Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms