Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms