Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrx2Q06348 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms