Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms