Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl7Q03366 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms