Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms