Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms