Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Il6stQ00560 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms