Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms