Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms