Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms