Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SmsP97355 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SmsP97355 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SmsP97355 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SmsP97355 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SmsP97355 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SmsP97355 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SmsP97355 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms