Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcaP82350 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcaP82350 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms